Вот, набросал про GPIO:
http://wiki.virt2real.ru/wiki/Управление_GPIO
http://wiki.virt2real.ru/wiki/Конфигурирование_пинов_ввода-вывода_(не_только_GPIO)
Вариант установки пинов стандартными линуховыми средствами (экспорт) почему-то работает только если сначала пин установить в 1 с помощью драйвера /dev/v2r_pins. Есть подозрения почему, но ещё не проверял. Но вообще драйвером управлять пинами удобнее, быстрее и проще.
Про отличия GPIO от CON, надеюсь, написал понятно.