Я немног поигрался с UART1 и передачей через него на полной скорости.
Long story short: 115200 переваривается без проблем.
Видимо, проблема имено в использовании UART0 и того, что его слушает по умолчанию.
Подробнее сейчас отдельный пост запилю.
UPD: viewtopic.php?f=38&t=14722
Мой очень небольшой опыт ковыряния с APM говорит, что MAVlink от APM прёт гораздо меньше, чем 115200 бит/сек.