Очень много попыток и с разными флешками было сделано, пользовался стандартной программой dd и её улучшенной версией dcfldd (она как минимум пишет текущий прогресс). dd всегда, вообще всегда говорил, что все хорошо, весь образ записан, но как оказалось он нагло врал.
Вобщем если у вас как и у меня, заливается легко и весело но ничего не работает потом, не поленитесь после работы программы dd запустить еще и команду sync, которая насильно запишет все кешированные ядром операции на диск. Как только sync отпустит терминал, так значит все - все, что можно было записать записалось.
У меня недозапись проявлялась тем, что присутствовал boot раздел, а rootfs была битой в 100% случаев. Wrong fs type, wrong superblock и бла-бла (при ранних версиях образов причем такого не проявлялось, когда я только купил виртурилку, первые образы писались на этой же машине на ура(и кстати до сих пор норм записываются))